Lors du match nul du Betis (0-0) vendredi à Osasuna, Fekir, auteur de deux buts cette saison en Liga, avait été contraint de quitter ses partenaires à la 73e minute.
Les examens passés par l'international français aux 22 sélections "ont révélé qu'il souffre d'une lésion musculaire myofasciale de grade 1 du biceps fémoral de sa cuisse gauche", précise le communiqué du club andalou.
"La durée de son absence dépendra de son évolution", ajoute le texte.
Selon le journal sportif sévillan 'Estadio Deportivo', le joueur de 26 ans ne prendra pas part à la réception de Levante pour la 6e journée de Liga et est très incertain pour le déplacement des siens à Villarreal vendredi.
Sa participation aux matches des Bleus prévus en octobre pourrait être remise en cause.
Le Betis, actuel 14e du championnat d'Espagne, a également indiqué que son défenseur central brésilien Sidnei, forfait à Osasuna, souffrait lui d'une blessure aux adducteurs.