Baxter avait été nommé sélectionneur en mai 2017, mais n'avait pas réussi à qualifier l'Afrique du Sud au Mondial de Russie. Sous ses ordres, les Bafana Bafana n'avaient gagné qu'un seul match sur cinq, et n'avaient pas pu se qualifier.
Le revers a été difficile à encaisser mais l'Anglais avait été confirmé à son poste. Il est parvenu à qualifier son équipe pour la CAN 2019, non sans peine, et a pu montrer un tout autre visage.
Il a atteint les quarts de finale, éliminant le pays hôte, l'Égypte, en huitièmes de finale, mais a été éliminé par le Nigéria en quarts de finale.
Passées quelques semaines pour digérer le résultat, Stuart Baxter a présenté sa démission au poste de sélectionneur de l'Afrique du Sud. Le nom de son successeur est pour le moment inconnu.
C'était la deuxième fois qu'il reprenait l'Afrique du Sud. La précédente, c'était entre mars 2004 et novembre 2005, où il avait de nouveau failli dans sa mission d'amener les Bafana Bafana au Mondial en Allemagne.