Le portier du Bayern Munich "ne se sentait pas bien" et a décidé de ne pas prendre l'avion avec l'équipe pour aller disputer cette rencontre, indique la DFB.
Les deux autres gardiens convoqués par le sélectionneur Joachim Löw sont Marc-André ter Stegen, du FC Barcelone, et Bernd Leno, du Bayer Leverkusen.
L'Allemagne est en tête de son groupe de qualification au Mondial russe, avec trois victoires pour ses trois premiers matches.
Après San Marin, les champions du monde doivent disputer mardi un amical de prestige à Milan contre l'Italie.
Les autres absents notoires de ce rendez-vous international côté allemand seront Toni Kroos (Real Madrid/fracture au pied droit), Jérôme Boateng (Bayern/genou), Julian Draxler (Wolfsburg/ adducteurs) ainsi que Mesut Özil, non convoqué par le sélectionneur pour lui donner du temps de repos.
Le jeune Julian Brandt, également appelé cette semaine, a pour sa part renoncé au voyage en raison de désordres intestinaux.