La vidéo en question a également fait réagir la ministre de la Culture et des Sports, Miri Regev.
La fédération israélienne "condamne l'attitude attribuée à un footballeur de première division telle qu'elle apparaît dans cette vidéo", a-t-elle fait savoir dans un communiqué sans nommer le joueur.
Cependant, "après en avoir examiné les aspects légaux, nous avons décidé de ne pas porter cette affaire devant le tribunal de la fédération", a-t-elle indiqué.
Gaëtan Antony Varenne, 27 ans, attaquant du Beitar Jérusalem depuis le début de la saison, est l'un des piliers du club, actuellement deuxième au classement du championnat israélien.
Il a joué en 2012-2013 à Bastia, alors en Ligue 1, puis a immigré en Israël et évolué dans différents clubs avant d'intégrer le Beitar Jérusalem, où il a inscrit 15 buts en 19 matches.
Selon les médias israéliens, la vidéo apparue ces derniers jours sur les réseaux sociaux est ancienne et montre plusieurs joueurs, dont Gaëtan Varenne, avec une femme.
Un porte-parole de la police a affirmé à l'AFP que "la police vérifiait si il y avait matière à ouvrir une enquête".
Le Beitar Jérusalem a dit ne pas "s'emprêsser de prendre une décision avant les conclusions de l'enquête de la police".
"Ces images ont apparemment été filmées avant que ce joueur ne signe au Beitar et nous sommes surpris que le club et ses dirigeants soient attaqués dans cette affaire", poursuit le communiqué qui n'identifie pas le joueur.
"Le Beitar Jérusalem condamne tout ce qui pourrait être interprété comme du harcèlement sexuel", ajoute le communiqué.
La ministre de la Culture et des Sports a de son côté dénoncé "toute forme d'attitude irrespectueuse envers les femmes".
Le joueur n'a pas pu être joint.